Le projet BEENOMIX a choisi comme objectifs de sélection :

• Le comportement hygiénique des abeilles permet de produire des familles plus saines et plus tolérantes aux parasites ;
• La docilité pour faciliter la gestion de la famille ;
• La production de miel, première source de revenus ;
• Faible propension à l’essaimage.

La mesure précise de ces phénotypes nécessite du temps et un effort matériel considérable. Il s’agit également, en particulier pour les comportements hygiéniques, de mesures qui doivent être répétées plusieurs fois afin d’obtenir une estimation précise du caractère. C’est pourquoi il s’écoule plus d’un an entre le moment de la première constitution de la famille à évaluer et celui du choix des meilleurs comme parents de la génération suivante.

Le cycle est donc biennal: la première année, les familles sont mesurées et évaluées génétiquement, et la deuxième année, les reproducteurs sont choisis, des faux-bourdons et des reines vierges sont produits et emmenés dans une station isolée pour la fécondation. Les reines fécondées sont placées dans de nouveaux noyaux qui feront l’objet des mesures habituelles l’année suivante.

Pour optimiser le système, deux cycles (A et B) alternent au cours des années.