Consultez les Objectifs du projet BEENOMIX
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Consultez la section détaillée et téléchargez les PDF ci-dessous pour plus d'informations sur chaque sujet BEENOMIX
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Le projet repose sur une approche sélective innovante pour l’apiculture, qui favorise la mesure des phénotypes selon des méthodes standardisées et reproductibles, une utilisation ciblée de la fécondation naturelle en stations isolées et de l’insémination instrumentale, dans le cadre d’un précis schéma de sélection.
Les données collectées sur le terrain par les opérateurs, associées à un registre généalogique complet, sont traitées par l’équipe scientifique pour la bonne identification des reproductrices femelles (Queen Producing Queens) et des reproducteurs mâles (Drones producing Queens). Le développement d’indices génétiques BLUP basés sur le phénotype et la généalogie permet d’identifier le mérite génétique de chaque colonie.
Le groupe de travail Beenomix agit pour intensifier deux traits comportementaux qui induisent une atténuation substantielle de l’impact sur les ruches des changements climatiques en cours : l’allongement de la durée de la diapause hivernale et une relation équilibrée et durable entre la taille de la population d’abeilles et la quantité de couvain élevé par eux.
L’échantillonnage et l’analyse génomique sur la population Beenomix nous ont permis d’étudier la variabilité au niveau du SDL (Sed Determination Locus) pour déterminer le risque potentiel d’augmentation de la consanguinité au sein de la population. L’augmentation de l’homozygotie peut en effet conduire à une réduction de la viabilité du couvain.
Grâce à l’analyse génomique sur les marqueurs SNP, le projet a développé un outil de diagnostic capable d’identifier si une abeille appartient à des types génétiques spécifiques (races ou sous-espèces). Cette analyse permet également une caractérisation claire et spécifique de la population Beenomix sélectionnée, qui ne peut être entièrement superposée à aucune des sous-espèces étudiées (Ligustica, Carnica, Sicula, Mellifera, Buckfast).
Les efforts du groupe se concentrent actuellement sur le développement de traits génétiques de résistance à Varroa dans la population, auxquels est dédié un protocole expérimental spécifique. L’approche pratique repose sur l’utilisation de l’insémination instrumentale avec le sperme d’un seul mâle (Single Drone Insemination) et sur l’infestation artificielle et contrôlée de Varroa pour permettre une mesure précise de l’expression de traits comportementaux de résistance au parasite.
La génétique développée dans le cadre du projet est mise gratuitement à la disposition de tous les apiculteurs lombards qui rejoignent la station de fécondation mise en place dans la Val Bodengo (SO). Dans une vallée alpine isolée, les reines vierges amenées par les apiculteurs peuvent être fécondées naturellement par des mâle sélectionnés par le groupe Beenomix.
Évaluation générique de BLUP 2020
Évaluation générique de BLUP 2020
Un objectif important du projet Beenomix 2.0 a été atteint dès mars 2020, malgré la pandémie en cours, en générant des index génétiques basés sur les phénotypes collectés au cours de la saison 2019 précédente. En plus des données phénotypiques, toutes les relations de parenté acquises lors du précédent projet Beenomix ont été incluses dans l’évaluation génétique. Le fichier principal utilisé avait la structure suivante
Au total, 1056 individus, dont 1038 mères et 796 pères. La répartition des données par année est la suivante. Rappelons que le système sélectif de départ fonctionne annuellement sur 108 colonies.
Sur la base de la matrice de parenté, le groupe de travail (Stefano Biffani, Giulio Pagnacco et Maria Grazia De Iorio) a calculé les indices BLUP – ST pour l’ensemble des archives à partir de 2015. Au total, 394 ont été attribués par kg de miel, 246 pour la docilité et 235 pour le comportement hygiénique. Les indices génétiques sont appelésEBV (Estimated Breeding Value).
Le modèle, le modèle allemand classique, comprend : la moyenne générale, les effets environnementaux de l’année, le rucher et l’interaction entre ces deux éléments. Viennent ensuite les effets génétiques des ouvrières d’une certaine famille (effet direct sur la production) et de la reine qui dirige cette famille (effet maternel), ainsi que l’effet de l’erreur. L’indice d’une colonie donnée est donné par la somme de l’effet direct et de l’effet maternel de cette colonie.
Les indices pour les trois caractères ont ensuite été pondérés en un seul indice agrégé appelé IMEL, dans lequel les pondérations attribuées aux trois caractères reflètent les accents sélectifs suivants :
1 par kg de miel
0,8 pour la docilité (HB)
0,4 pour le comportement hygiénique
L’indice agrégé n’ayant pas d’unité de mesure propre, l’IMEL a été redimensionné en utilisant la variabilité du kg de miel, qui est certainement plus familière aux apiculteurs.
Les corrélations entre les indices et entre ceux-ci et les phénotypes originaux sont indiquées ci-dessous.
Les corrélations sont toutes positives (ce qui est très avantageux) et donc, en sélectionnant l’un des caractères, les autres suivent favorablement. La corrélation entre les indices et les phénotypes correspondants est très bonne, comme prévu.
Les corrélations entre les indices ne sont pas de véritables corrélations génétiques, mais elles s’en approchent.
Le classement des colonies mesurées en 2019 a permis d’identifier celles à partir desquelles les translocations nécessaires (2020) ont été effectuées pour constituer la nouvelle population de sélection. En particulier, la grand-mère maternelle à partir de laquelle les futurs DPQ seront élevés et les mères des 108 reines dont les colonies seront évaluées en 2021 ont été identifiées.
Les évaluations génétiques ont été effectuées en obtenant d’abord des estimations des variances des composantes aléatoires du modèle (VQ,VW etVE) ainsi que de la covariance entre Q et W (CovQ,W).
